L’organisation administrative de la Commission scolaire des Découvreurs est divisée en 5 services. Ces services sont sous la responsabilité de la Direction générale. Ce sont le Secrétariat général et le Service des technologies de l'information, les Services éducatifs, le Service des ressources humaines, le Service des ressources financières et du transport scolaire ainsi que le Service des ressources matérielles (La Commission scolaire des Découvreurs en bref).